原子熒光光譜儀主要在中藥中砷、汞、硒、鎘、鉛、銻和鍺等金屬元素分析中得到了應用。
1、通訊失敗：
產生原因之一是先開軟件后開儀器，由于在儀器關閉狀態下電腦軟件無法接收儀器傳輸的信號，導致出現錯誤。
正確順序是先開儀器，等30s-1min后儀器穩定下來再打開軟件。
2、氬氣不足：
氬氣剩余量不足以支持實驗用量，要及時更換氬氣，否則在實驗過程中提示氬氣不足而中斷。
在測試之前要先打開氬氣瓶，貫通氣流，不然開機后測量樣品溶液，溶液會出現倒灌現象，對管路系統造成腐蝕。
3、元素燈：
用電子脈沖點火器激發點燈。
4、三通閥漏液：
更換三通閥。
5、注射器：
更換新的注射器。
6、蠕動泵和膠管：
蠕動泵壓頭松緊程度適當，不要空載運行。
如果長期不用時要松開泵管，防止將膠管擠壓變形。另外膠管（紅色圈圈）也要注意被腐蝕漏液現象。